Логично же, что разряжать средним потребляемым мотором током (смотрим по номинальному току контроллера, например написано 7(14) ампер, значит берем 7 ампер). Разряжать до нижнего напряжения АКБ. Считаем исходя из 3,0 В на элемент (серию). для 10s - это 30 вольт.