По хорошему запараллелить все ячейки, пусть выровняются. А потом уже собирать батарею. Если так не вариант, то подбирать для параллели те ячейки, которые ближе всего друг к другу по напряжению. Т.е. 3.35+3.35+3.35 это первая ячейка, 3,38+3,36+3,36 вторая, и.т.д