что я вижу, аккумулятор посадил до SoC=45%, а зарядный ток после запуска двигателя составил 40А и после 40 минут поездки упал до 8А.
нормально. Так бывает сплошь и рядом в АКБ автомобильных. Главное что генератор выдержал, обычно весь ток генератор ане выше 100А.
Понимаю, что скорее всего Акб не успел закипеть, но что происходит с пластинами при 40А?
ничего не происходит, если эти (40А) не носят постоянный характер. Пластины не успеют покоробиться, автомобильные АКБ конструктивно рассчитаны на отдачу больших токов (200-500Ампер), но в кратковременном (пуск ДВС стартером) режиме.
"Голодный" АКБ в состоянии "сьесть" и большИе токи.
Но АКБ заряжать надо токами близкими к 0.1С (С=число емкости написанной на боку АКБ), подзарядите АКБ и не доводите до таких "быстрых зарядов".